СИСТЕМЫ ПРАЙМЕРОВ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ СООБЩЕСТВА ХЕМОЛИТОТРОФНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ МЕСТОРОЖДЕНИЯ ШАНУЧ (КАМЧАТКА)

 

DOI: 10.24411/1728-323X-2018-12060

Раздел

Экология

Название

СИСТЕМЫ ПРАЙМЕРОВ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ ПРЕДСТАВИТЕЛЕЙ СООБЩЕСТВА ХЕМОЛИТОТРОФНЫХ МИКРООРГАНИЗМОВ МЕСТОРОЖДЕНИЯ ШАНУЧ (КАМЧАТКА)

Авторы

С.        В. Рогатых, старший научный сотрудник, Научно-исследовательский геотехнологический центр Дальневосточного отделения Российской академии наук, Петропавловск-Камчатский, Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Аннотация

В статье приведены экспериментальные данные, полученные при разработке тест-систем, основанных на полимеразной цепной реакции, необходимых для качественного и количественного анализа оценки структуры сообществ хемолитотрофных ацидофильных микроорганизмов Acidithiobacillusthiooxidans, Acidithiobacillusferrooxidans, Sulfobacillusthermosulfidooxidans и Ferroplasmaacidiphil- lum, выделенных из сульфидных руд медноникелевого месторождения Шануч (полуостров Камчатка). На основании последовательностей, полученных для образцов A. thiooxidans и A. ferrooxidans были созданы системы олигонуклеотидов, обладающие видовой специфичностью, которые использовали впоследствии в реакции генотипирования. Для разработки праймеров S. thermosulfidooxidans и F. acidiphillum были использованы последовательности базы данных GenBank. Выравнивание полученных последовательностей позволило выявить вариабельные участки в геномах A. thiooxidans и A. ferrooxidans и использовать их впоследствии при написании видоспецифичныхолигонуклеотидов. Специфичность праймеров, использованных в исследовании, проверяли методом секвенирования. Последовательности всех полученных ПЦР-продуктов соответствовали последовательностям, полученным для коллекции клонов.

Ключевые
слова

биовыщелачивание, олигонуклеотиды, ацидофильные микроорганизмы, микробное сообщество, медно-никелевое месторождение.

Библиографический список

1. Булаев А. Г., Першина Е. В., Украинцев И. В. Состояние развития современных биогидрометаллургическихтехно-логий и перспективы их использования в России // Цветные металлы. — 2016. — № 10. — С. 29—35.

2. Хайнасова Т. С., Левенец О. О. Бактериально-химическое выщелачивание как экологически безопасный способ пе-реработки сульфидной кобальт-медно-никелевой руды // Разведка и охрана недр. — 2015. — № 1. — С. 49—54.

3. Кондратьева Т. Ф., Булаев А. Г., Муравьев М. И. Микроорганизмы в биогеотехнологиях переработки сульфидных руд. — М.: Наука, 2015. — 206 с.

4. Совмен В. К., Гуськов В. Н., Белый А. В. Переработка золотоносных руд с применением бактериального окисления в условиях Крайнего Севера. — Новосибирск: Наука, 2007. — 144 с.

5. Рогатых С. В., Докшукина А. А., Левенец О. О., Мурадов С. В., Кофиади И. А. Оценка качественного и количест-венного состава сообществ культивируемых ацидофильных микроорганизмов методами ПЦР-РВ и анализа библиотеки клонов // Микробиология. — 2013. — Том 82. — № 2. — С. 212—217.

6. Заулочный П. А. Интенсификация технологии бактериального выщелачивания упорных золотосульфидных кон-центратов с использованием ассоциации микроорганизмов, включая умеренно-термофильные бактерии: дис. ... канд. техн. наук: 25.00.13. — М., 2011. — 168 с.

7. Aswegen P. C. van, Niekerk J. van, Olivier W. The BIOX™ process for the treatment of refractory gold concentrate // In: Biomining. Ed. by D. E. Rawlings and D. Barrie Johnson. Springer—Verlag Berlin Heidelberg, 2007. — P. 1—35.

8. Foucher S., Battaglia-Brunet F., d’Hugues P., Clarens M., Godon J. J., Morin D. Evolution of the bacterial population during the batch bioleaching of a cobaltiferous pyrite in a suspended-solids bubble column and comparison with a mechanically agitated reactor // Hydrometallurgy. — 2003. — No. 71. — P. 5—12.

9. Harvey T. J., Bath M. The GeoBiotics GEOCOAT® Technology — progress and challenges // In: Biomining. Ed. By

D.        E. Rawlings and D. Barrie Johnson. Springer—Verlag Berlin Heidelberg, 2007. — P. 97—112.

10.       Puhakka J. A., Kaksonen A. H., Riekkola-Vanhanen M. Heap Leaching of Black Schist // In: Biomining. Ed. By

D.        E. Rawlings and D. Barrie Johnson. Springer—Verlag Berlin Heidelberg, 2007. — P. 139—152.